مادری که پس از فاجعه ای بزرگ به دنبال پسر گمشده اش می گردد، متوجه می شود که مرده و حالا در قلمروی ارواح سرگردان گرفتار شده است.

امی و جیمی دو همکار صمیمی هستند، اما امی ناگهان ناپدید می‌شود. هجده سال بعد، جیمی کارت‌پستالی از امی پیدا می‌کند که جرقه‌ای برای سفری به ژاپن می‌زند تا پایان داستان را پیدا کند.

در دهکده ای که زمانی خوش منظره و اکنون یک مکان دفن زباله است، مرد جوانی آرزوی رهایی از سرنوشت ظالمانه ای را دارد که او را به همان زمین گره زده است.

در سال 2045، سایبرنتیک موتوکو کوساناگی به بخش 9 باز می گردد تا با یک تهدید جدید خطرناک روبرو شود: پساانسان ها ...

داستان این فیلم، از آنجایی آغاز می شود که «کنجی» به دلیل درگذشت پدرش، بر اثر استفاده از داروی محرک، به یاس عمیقی دچار می شود. سپس کنجی به یک سندیکای جنایتکار ملحق می شود و در آنجا با رئیس باند، «هیروشی شیباساکی» دیدار می کند و با او رابطه بسیار نزدیکی برقرار می کند؛ اما...