گودزیلا و کونگ با یک هیولای وحشتناک و خطرناک که همه موجودات و انسان ها در کره زمین را در معرض خطر تهدیدآمیزی قرار می دهد، روبرو می شوند و...

داستان فیلم در خصوص تلاش‌های قهرمانانه‌ی سازمان نهان‌جاندارشناسی مونارک است که اعضایش با تنش و درگیری میان هیولاهای غول‌پیکر مواجه می‌شوند. از جمله گودزیلای قدرتمند که با ماترا ، رودان و حریف نهایی‌اش گیدورا شاه سه سر روبرو می‌شود. هنگامی که این ابرموجودات باستانی که گمان می‌شد افسانه هستند ، دوباره ظاهر می‌شوند ، همگی برای برتری رقابت می‌کنند و…